Το 1947 απολύθηκε από τη θέση του στο πανεπιστήμιο και εκτοπίστηκε έως το 1950, στη Μακρόνησο.
Το 1990 προτάθηκε από τον Συνασπισμό για το αξίωμα του Προέδρου της Δημοκρατίας, ενώ διατέλεσε και υπουργός Παιδείας.
Τη θλίψη του για τον θάνατο του Κ. Δεσποτόπουλου εξέφρασε ο ΣΥΡΙΖΑ, σημειώνοντας ότι «ο πνευματικός κόσμος της Ελλάδας έγινε φτωχότερος».
Η απώλειά του είναι μεγάλη, δήλωσε και ο πρόεδρος της Ν.Δ., Κυριάκος Μητσοτάκης.
Από την πλευρά του, ο Πρόεδρος της Δημοκρατίας, Προκόπης Παυλόπουλος έκανε λόγο για έναν «κορυφαίο πνευματικό ταγό της εποχής μας» και για «έναν γνήσιο εκπρόσωπο και εκφραστή του αρχαίου ελληνικού πνεύματος, ο οποίος υπηρέτησε τον πολιτισμό και τη δημοκρατία».
«Η μνήμη του και το έργο του συνιστούν πραγματική εθνική μας κληρονομιά» κατέληξε.
