Η µετάβαση του ΟΠΕΚΕΠΕ στην ΑΑ∆Ε δεν είναι µια απλή διοικητική αλλαγή. Με βάση τα µέχρι σήµερα δεδοµένα, παρατηρούνται τεράστιες δυσκολίες τεχνικής προσαρµογής, διασταύρωσης δεδοµένων και επανελέγχου φακέλων, που οδηγούν τη διαδικασία των πληρωµών σε πολύ µεγάλες καθυστερήσεις.