Σύμφωνα με την απόφαση, ο Ενιαίος Φορέας Ελέγχου Τροφίμων (ΕΦΕΤ), ως Αρχή Οργάνωσης Εποπτείας και Συντονισμού, αναλαμβάνει τον καθορισμό μακροπρόθεσμων και ετήσιων στόχων για τους επίσημους ελέγχους, σε συνεργασία με τις Περιφερειακές Διευθύνσεις του και τις συναρμόδιες ελεγκτικές υπηρεσίες. Οι μακροπρόθεσμοι στόχοι θα έχουν διάρκεια έως πέντε έτη και θα μπορούν να αναθεωρούνται, εφόσον οι συνθήκες το απαιτούν.
Στο νέο σύστημα συμμετέχουν, μεταξύ άλλων, οι Διευθύνσεις Αγροτικής Οικονομίας και Κτηνιατρικής, οι Διευθύνσεις Ανάπτυξης, οι υπηρεσίες Δημόσιας Υγείας των Περιφερειών και των Περιφερειακών Ενοτήτων, καθώς και οι αρμόδιες περιφερειακές υπηρεσίες του Γενικού Χημείου του Κράτους. Η απόφαση διευκρινίζει ότι η διαδικασία αφορά την αξιολόγηση των εποπτικών δράσεων και όχι την ατομική αξιολόγηση του προσωπικού.
Η αποτελεσματικότητα των ελεγκτικών μηχανισμών θα αποτιμάται μέσω συγκεκριμένων δεικτών απόδοσης. Μεταξύ αυτών περιλαμβάνονται το ποσοστό υλοποίησης του ετήσιου προγράμματος ελέγχων, τα ποσοστά μη συμμόρφωσης κατά τον αρχικό έλεγχο και τον επανέλεγχο, ο βαθμός συμμόρφωσης των επιχειρήσεων, ο μέσος αριθμός ελέγχων ανά κλιμάκιο και το λειτουργικό κόστος ανά έλεγχο.
Παράλληλα, θα αξιολογούνται η αποτελεσματικότητα στη διαχείριση των καταγγελιών, το ποσοστό των ελέγχων που πραγματοποιούνται έπειτα από καταγγελία και οδηγούν στην επιβολή κυρώσεων, η εκπαίδευση των ελεγκτών, καθώς και η σχέση μεταξύ πραγματικού και προϋπολογισμένου κόστους των ελέγχων.
Κεντρικό εργαλείο του νέου πλαισίου αποτελεί η ετήσια έκθεση δραστηριοτήτων του ΕΦΕΤ, η οποία θα καταγράφει τα αποτελέσματα των ελέγχων, τις μη συμμορφούμενες εγκαταστάσεις, τις εισηγήσεις για επιβολή προστίμων, τα εργαστηριακά ευρήματα, τις σημαντικότερες παραβάσεις και τις πιθανές επιπτώσεις τους στη δημόσια υγεία.
Η έκθεση θα υποβάλλεται έως το τέλος κάθε έτους στον υπουργό Αγροτικής Ανάπτυξης και Τροφίμων, με δυνατότητα οριστικοποίησης των στοιχείων έως τις 31 Μαρτίου του επόμενου έτους, και στη συνέχεια θα δημοσιοποιείται, ενισχύοντας τη διαφάνεια και τη λογοδοσία των ελεγκτικών μηχανισμών.
