Σύμφωνα, μάλιστα, με το ρεπορτάζ της εφημερίδας Agrenda, στην Απονιτροποίηση η τροποποίηση των κριτηρίων µοριοδότησης προκύπτει από την ανάγκη να µην υπάρξουν πολλές ισοβαθµίες σε περίπτωση που οι αιτήσεις ξεπεράσουν τον προϋπολογισµό του Μέτρου ώστε να αποφευχθεί το φαινόµενο πολλαπλών απεντάξεων χωρίς να απορροφάται όλο το ποσό. Σηµειώνεται ότι κάτι τέτοιο συνέβη στα Βιολογικά και τελικά απορρίφθηκαν όλοι οι κτηνοτρόφοι.
Πιο συγκεκριμένα τα νέα κριτήρια μοριοδότησης τα οποία θα παίξουν ρόλο μόνο εφόσον ξεπεραστεί το μπάτζετ ώστε να τηρηθεί προτεραιότητα αναλόγως τη μεγαλύτερη βαθμολογία έχει ως εξής:
1. Υπόγεια υδατικά συστήματα με κακή ποιοτική (χημική) κατάσταση.
1.1 Συνολική υπό ένταξη γεωργική γη (Ha) σε υπόγεια υδατικά συστήματα με κακή ποιοτική (χημική) κατάσταση. (0.05-1=1, 1.01-2=2, 2.01-3=3, …, 98.01-99=99, ≥99.01=100): 1 – 100 μόρια
2. Εκμεταλλεύσεις που βρίσκονται σε προστατευόμενη περιοχή (περιοχές NATURA, θεσμοθετημένες περιοχές εθνικών πάρκων).
2.1 Συνολική υπό ένταξη γεωργική γη (Ha) που βρίσκεται εντός προστατευόμενης περιοχής (περιοχές NATURA, θεσμοθετημένες περιοχές εθνικών πάρκων). (0.05-1=0.2, 1.01-2=0.4, 2.01-3=0.6, …, 98.01-99=19.8, ≥99.01=20): 0.2-20 μόρια
Σημειώνεται εδώ ότι ως προς τα κριτήρια που έχουν προβλεφθεί στο ΦΕΚ δεν έχουν αλλάξει οι αρχές παρά μόνο οι βαθμοί που δίνονται ανά ποσοστό της υπό ένταξης γης, ώστε να αποφθευχθούν οι πολλές ισοβαθμίες και να πριμοδοτηθούν περισσότεροι όσοι έχουν άνω των 100 στρεμμάτων γης σε περιοχές με κακή χημική κατάσταση υπόγειων υδάτων.